- Phòng thí nghiệm Trọng điểm Công nghệ Enzym và Protein
+ Giám đốc PTN: PGS.TS. Nguyễn Quang Huy
+ Năm thành lập: 2003
+ Cấp độ: Quốc gia
- Phòng thí nghiệm Trọng điểm Tính
toán đa tỷ lệ cho các hệ phức hợp
+ Giám đốc PTN: GS.TS. Nguyễn Thế Toàn/
GS.TS. Paolo Carloni
+ Năm thành lập: 2016
+ Cấp độ: ĐHQGHN
- Phòng thí nghiệm Trọng điểm Phát
triển năng lượng sinh học
+ Giám đốc PTN: GS.TS. Lê Thanh Sơn/ GS.TS. Maeda Yasuaki
+ Năm thành lập: 2016
+ Cấp độ: ĐHQGHN
+ Có nhóm Nghiên cứu mạnh
- Phòng thí nghiệm Trọng điểm Vật
liệu tiên tiến ứng dụng trong phát triển xanh
+ Giám đốc PTN: GS.TS. Nguyễn Văn Nội/ GS.TS Takehiko Kitamori
+ Năm thành lập: 2016
+ Cấp độ: ĐHQGHN
+ Có nhóm Nghiên cứu mạnh
- Phòng thí nghiệm Trọng điểm Công nghệ phân tích phục vụ kiểm định môi trường và an
toàn thực phẩm
+ Giám đốc PTN: GS.TS. Phạm Hùng Việt
+ Năm thành lập: 2016
+ Cấp độ: ĐHQGHN
+ Có nhóm Nghiên cứu mạnh
- Phòng thí nghiệm Trọng điểm Địa
môi trường và Ứng phó biến đổi khí hậu
+ Giám đốc PTN: PGS.TS. Nguyễn Tài Tuệ
+ Năm thành lập: 2016
+ Cấp độ: ĐHQGHN
- Phòng thí nghiệm Trọng điểm Công
nghệ môi trường và tái chế chất thải
+ Giám đốc PTN: GS.TS. Nguyễn Mạnh Khải
+ Năm thành lập: 2023
+ Cấp độ: ĐHQGHN
+ Có nhóm Nghiên cứu mạnh
Trung tâm Nghiên cứu Công nghệ Môi trường và Phát triển bền vững
Trung tâm Nghiên cứu Quan trắc và Mô hình hóa Môi trường
Trung tâm Động lực học Thủy Khí Môi trường
Trung tâm Nano và Năng lượng